Workshop on big data in biology

Wednesday, 23 March 2016

Moscow Institute of Physics and Technology, Institute for Information Transmission Problems, Higher School of Economics, Laboratoire J.-V. Poncelet, Moscow, Russia 

Незаданные вопросы в биологии больших данных

(big data in biology)

 

23 марта 2016 года в МФТИ

Затравочные сюжеты для обсуждения

1. Егор Васецкий (Villejuif)

Вводное слово: зачем мы собрались? (10 мин)

 

2. Григорий Кучеров (Universite Marne la Vallee)

Massive metagenomic classification (10 мин)

 

3. Валентина Боева (INSERM)

Проблемы «очистки» сигнала, происходящего из смеси раковых и нормальных клеток для данных секвенирования генома, транскриптома и эпигенома (10 мин)

 

4. Анна Полесская (BIOC, Ecole Polytechnique)

РНК-связывающие белки, микроРНК и регуляция экспрессии генов (10 мин)

 

5. Андрей Миронов (ФББ МГУ, ИППИ РАН)

Stereogene - быстрый метод поиска корреляций геномных разметок (10 мин)

 

6. Евгений Шеваль (НИИ физико-химической биологии им. Белозерского МГУ)

Механизмы биогенеза клеточных структур (10 мин)

 

7. Сергей Нечаев (LPTMS Orsay, лаборатория Понселе, ФИАН РАН)

Некоторые статистические вопросы в анализе больших массивов: а) роль шума в редких событиях, б) ультраметрика больших данных, в) поиск корреляций с помощью анализа «дистантных» матриц (10 мин)

 

8. Александр Чертович (Физически факультет МГУ)

Способы восстановления трехмерных конформаций из хромосомных контактных карт (10 мин)

 

9. Алексей Драль (AMAZON, АТП ФИВТ МФТИ)

 Определение пола пользователя по его поведению в интернете (10 мин)

 

10. Всеволод Макеев (Институт общей генетики РАН им. Н.И. Вавилова)

Автоматические и ручное управление при работе с большими данными. Опыт анализа ДНК-белковых взаимодействий (10 мин)